Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios


Um dos grandes problemas a ser enfrentados pela ciência moderna, e em particular pela biotecnologia, é a grande quantidade de dados gerada pelos métodos de experimentação em larga escala modernos. Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um sistema de gerência integrado de laboratórios, SIGLa, com ênfase em laboratórios de proteômica. Proteômica consiste da identificação do exato conteúdo protéico de uma dada amostra. É um problema muito importante e complexo que exige uma sequência de experimentos que têm que ser relacionados entre si a fim de que se identifique corretamente as proteínas. Assim, experimentos em proteômica são limitados pela capacidade de análise dos dados. O sistema SIGLa propõe uma ferramenta altamente eficiente para permitir esta análise com diversas vantagens: (1) O sistema importará dados diretamente do equipamento, aumentando a eficiência da coleta de dados. (2) Será possível efetuar diversas análises de dados não disponíveis hoje, e.g., correlacionar os valores de determinados atributos dos experimentos entre todos os experimentos existentes a fim de identificar similaridades. (3) O SIGLa utilizará um sistema de gerência de workflows. Utilizando-se workflows, o usuário final pode definir e alterar os protocolos que serão gerenciados, uma funcionalidade essencial, uma vez que em cada laboratório existe um grande número de protocolos, e uma estrutura rígida impediria sua utilização sem alterações frequentes em seu código. O projeto SIGLa tem como objetivo final permitir a integração e gerenciamento de dados biológicos complexos. O projeto será desenvolvido no Departamento de Ciência da Computação da UFMG mas terá como parceiros pesquisadores do Instituto de Ciências Biológicas e do programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG. Dentro dos projetos que participarão deste desenvolvimento podemos citar O Uso do Proteômica e da Bioinformática na Caracterização de Produtos Gênicos de Schistosoma mansoni , Análise do Proteoma Solúvel do Agente Etiológico da Linfadenite Caseosa, Corynebacterium pseudotuberculosis , Identificação de Genes Diferencialmente Expressos nas Raízes de Linhagens Contrastantes de Milho em Resposta ao Défict Hidrico dentro da UFMG, além de empresas de biotecnologia que manifestaram interesse na utilização desta tecnologia, como por exemplo, a Prodimol Tecnologia, a Biocod Biotecnologia, o Hospital Belo Horizonte e o Centro de Pesquisas René Rachou da Fundação Oswaldo Cruz. Dada a significativa participação de pesquisadores e grupos de pesquisa da área biológica, é importante ter a participação de um pesquisador que tenha conhecimentos em bioinformática e em biologia a fim de garantir que o desenvolvimento do projeto explore todas as oportunidades de pesquisa e que atenda aos seus usuários finais. O bolsista do projeto SIGLa atuará então como membro de ligação entre as duas áreas. Sua presença é importante não somente pelo projeto SIGLa como também para fortalecer a área de bioinformática na UFMG, uma área nova e de excelente potencial, mas que necessita de pesquisadores dedicados à tarefa de transpor as diferenças entre as duas áreas de atuação e desta forma criar efetivamente uma nova área de pesquisa.

Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) .

Integrantes: Sergio Vale Aguiar Campos – Coordenador / Alessandra C FariaCampos – Integrante / Glória R Franco – Integrante / Guilherme Oliveira – Integrante / Adriano Pimenta – Integrante / Jader S. Cruz – Integrante / andrea Carneiro – Integrante.

Número de produções C, T A: 13

 Número de orientações: 6